规模化养殖场：就地就近全量还田——第三方商业化服务模式
针对场区面积有限或周边土地消纳面积不足的大型规模化养殖场，构建“就地就近全量还田——第三方商业化服务模式”。大型养殖场由于粪污产生量大且集中，养殖企业一般无法配套与粪污产量相适应的足够农田。如果养殖场直接寻找农户或企业签订合同，除了会带来时间和经济成本的提高之外，还可能存在非专业化还田造成的施用成本高和不合理施用所带来的环境问题。第三方专业化服务机构可以将养殖和种植联合起来，通过专业化的粪污收集、贮存和施肥管理，可以实现“三赢”的合作机制。
例如，黑龙江省哈尔滨市双城区引入北京丹青诺和牧业科技有限公司，正在探索粪肥施用的第三方商业化服务。该公司基于黑龙江省哈尔滨市双城区的规模化养殖场，建有公共粪肥存储池 100 个，粪肥播洒机及配套机械设备 50 套。该公司收集双城区的奶牛场、猪场粪污 2 万吨（干物质含量低于 12%），将收集的粪污存储在密闭存贮设施中；在春播前及秋收后，使用高效还田设备，按测土测粪配方进行均质、精准还田。目前该公司在双城区总投资 1 420 万元，包括服务站点和运输车辆 1 020 万元，养殖场粪污贮存池 400 万元；2016 年公司在双城区年运行成本 110 万元，公司向养殖场收取服务费 20 万元，向种植户收取粪肥农田施用费 112 万元，合计年收入 132 万元，预计随着服务客户的增加，收益会逐步增加。
特大型养殖企业：种养结合“全产业链自循环模式”
特大型养殖企业的养殖规模大、粪水资源多，可以大型沼气工程为核心，结合周边土地流转的方式，构建“畜禽养殖—生物工程—清洁能源—高效肥料—种植”有机衔接的种养结合“全产业链自循环模式”。养殖龙头企业可自建特大型沼气发电工程、特大型沼气压缩提纯工程、沼液浓缩工程和沼液有机种植生态基地（土地流转）等。通过沼气发电和生物天然气，可实现畜禽粪污的能源化和清洁利用；通过沼液浓缩工程，可实现沼液深度开发和利用，从而解决沼液用量大、运输难问题；通过土地流转构建有机种植生态基地，可用于沼液浓缩产品还田施用，以辐射周边县市，解决沼液养分循环，实现畜禽养殖无污染的清洁化、高收益的产业链条循环化、零排放的废弃物能源化和果树种植有机化的循环生态农业模式，有效解决了养殖污染问题。
例如，山东民和牧业股份有限公司目前采用的就是该模式。该公司年沼气发电 2 300 多万度，沼气提纯天然气 1 500 万立方米，年产固态生物有机肥 5 万吨，有机水溶肥 16 万吨。沼液施用于山东省蓬莱市刘家沟镇自建有机种植生态园，并辐射周边县市，基本做到了企业内无污染、零排放、高收益的自循环模式。